Piegare le proteine, aiutare a curare le malattie in Foldit Video Game

Lascia che i videogiocatori trovino un modo migliore per pastore di proteine ​​nelle loro forme tridimensionali ottimali.

Avvolgere un gioco liberamente disponibile e abbinare le routine automatizzate del computer progettate per accertare come gli aminoacidi si intrecciano nelle loro forme ideali, la rivista scientifica Nature riporta che i videogamer hanno preso il massimo dei voti, piegando le proteine ​​meglio di un computer.

Il gioco, chiamato Foldit (o Fold.it) comprende due anni di biochimica e informatica presso il Università di Washington. Il suo obiettivo era semplice: trovare un modo migliore e più veloce per piegare le proteine ​​sfruttando la potenza mentale dei videogamer.

"Le persone della comunità scientifica hanno conosciuto Foldit per un po 'e tutti hanno pensato che fosse una grande idea, "ha scritto l'ingegnere informatico associato UW e il professore di ingegneria Zoran Popovic in una dichiarazione stampa. "Ma la domanda fondamentale nella mente di molti scienziati era" Cosa può produrre in termini di risultati? C'è qualche prova che sta facendo qualcosa di utile? "

" Spero che questo documento possa convincere molte di quelle persone che erano seduto ai margini, e l'intero genere dei giochi di scoperta scientifica prenderà davvero il volo. "

Perché il ripiegamento delle proteine? Perché la proteina nutre i muscoli e aiuta a traghettare i segnali nel cervello che controllano il tuo corpo, e poiché un piegamento improprio, che può produrre proteine ​​inattive o piegate in modo errato, è associato a tutto, dalle allergie a diverse malattie neurodegenerative. Capire come le proteine ​​ dovrebbero piegare aiuta i ricercatori a predire e bersagliare le strutture proteiche con

Foldit, che funziona un po 'come il Tetris, chiede ai giocatori di piegare effettivamente una proteina scuotendo i sidechain, dimenando le dorsali e liberando le serrature e bande. E, si scopre, gli esseri umani sono notevolmente migliori dei computer quando scricchiolano i problemi che richiedono la presa del rischio e la previsione a lungo termine - entrambe le aree necessarie per accelerare il ripiegamento delle proteine.

Secondo la pagina "circa" di Foldit, "Il numero di differenti modi in cui anche una piccola proteina può piegarsi è astronomica perché ci sono così tanti gradi di libertà. "

" Capire quale delle molte, molte possibili strutture è la migliore è considerata uno dei problemi più difficili in biologia oggi e in i metodi richiedono molto tempo e denaro, anche per i computer. Pieghevoli tentativi di prevedere la struttura di una proteina sfruttando le intuizioni di risoluzione dei puzzle degli umani e il fatto che le persone giochino in modo competitivo per piegare le migliori proteine. "

Ricorda SETI @ casa? Avevo eseguito quell'app giorno e notte sul mio vecchio desktop, anche se meno - se sono totalmente onesto - per vedere se E.T. telefonava, piuttosto che ammirare quanto più velocemente il mio nuovo processore, qualunque potesse essere in grado di colpire gli algoritmi analitici della University of California Berkeley.

Passiva "vanità" scansione aliena, o decodifica attiva delle proteine ​​per mitigare o curare effettivamente le malattie neurodegenerative? Non è certo una scelta per i giocatori, è